内阁对此同样争议不小。户部尚书毕自严坚决反对罢三饷，除了财政亏空的理由之外，他还提出：都说三饷负担沉重，可认真算的话，其实并不算多。就以最多的辽饷为例，看起来辽饷每年五百万两的数额是不小，甚至比一年的田赋都多，但那是全国民田七百余万顷一共才派这么多，平均到一亩还不到九厘银子。

一两为十钱，一钱为十分，一分为十厘，按官价一两银子折千文铜钱算，一亩地才派九文铜钱。就算亩产一石，一石米价一两来算，加派之饷的税率连百分之一都不到，怎能算多？之所以有人嫌多，只是因为过去总是巧用各种名目，少纳了该纳的田赋，使得“正供”太少而已！

但只有徐光启支持他的主张，而东林系和温周系的阁臣则一致赞成罢饷。这两派一向互相唱反调，这次怎么就达成一致了呢？其实也很简单，他们都是地主富商的代言人，甚至本身就是大地主。虽然他们是官不用纳粮，但他们的亲族还是要纳粮的。

对这些地主富绅来说，田赋是越少越好，能不交就不交，如果有可能的话，朝廷倒找给他们银子才好呢！至于朝廷收不上来田赋，导致财政紧张，他们才懒得管。反正这天下都是皇上家的，皇上自会想办法，只要不让他们的小家受损失就行。

最后内阁不顾毕自严和徐光启的反对，强行做出票拟：罢除三饷。但光是票拟并不算数，只有皇帝批红方能生效。廷臣们与朱由检打了一年多交道，也深知这位年轻的皇帝不好对付，虽然前段时间下罪己诏后，基本上每票必准，但这回是涉及到三饷的大事，恐怕票拟会被驳回。为此东林系里面的笔杆子们也早做好了准备，只要皇帝一驳回，他们立即“据理力争”，非迫皇帝就范不可。

孰料票拟送进养心殿好几天，却一点动静也没有。到了该上朝的日子，皇帝索性传下口谕：因为偶感风寒，罢朝一日，各官有事只管递奏折。也有一些别的票拟得到了批红，唯独没有罢三饷这条。换句话说，票拟是被“留中”了。

这下阁臣们大为不满。因为过去朱由检也偶有把奏折留中的时候，但内阁票拟却从未留中过，要么批红，要么驳回。而留中就是不置可否，把你晾起来，这让满腔热情、一心准备战斗的东林系官员情何以堪！

于是以首辅李标为首，各路廷臣纷纷赶到乾清门外，要求进宫请安，说白了就是看皇帝是不是在装病。但乾清门早有秘书处的女官和腾骧右卫的侍卫值守，女官只羞答答地告诉他们，皇帝确实病了，再问则三缄其口。

有些不知好歹的东林系官员便欲硬闯，立刻被腾骧右卫毫不客气地拿下，以违反宫禁条例处以枷号一天，紫禁城外示众的惩罚。但这些人不以为耻反以为荣，还以“直臣”自居，企图以此博取众人同情，要挟皇帝。

但他们不知道的是，朱由检此时根本不在宫中。他正在畅春园的鸢飞鱼跃亭内深情地望着眼前的女子，而这名女子却双手反绑，对他怒目而视！